Eu finalmente descobri o problema: -
1. excluir pacotes parciais usando
sudo -i
rm /var/lib/apt/lists/partial/*
exit
2. então atualizando e atualizando pacotes
sudo apt update
sudo apt upgrade
3. pipeline broken warning
foi corrigido adicionando linhas abaixo em /etc/apt/apt.conf
Acquire::http::No-Cache true;
Acquire::http::Pipeline-Depth 0;