Aqui está uma resposta um pouco mais completa. Adicione as fontes ao seu arquivo /etc/apt/sources.list digitando o seguinte texto na linha de comando em uma janela de terminal:
sudo gedit /etc/apt/sources.list
(Eu sei que existem maneiras mais limpas de fazer isso, mas o gksu não está funcionando no meu sistema por algum motivo.) Isso abre uma janela de texto no gedit com todos os endereços do repositório de pacotes de software. Não mude mais nada neste arquivo; na parte inferior apenas adicione:
deb http://qgis.org/debian yakkety main
deb-src http://qgis.org/debian yakkety main
Agora faça o comando update (abaixo), mas saiba que ele falhará na primeira vez:
sudo apt update
Por volta da quinta linha, meu terminal retornou uma ERR e disse que a chave pública para esse arquivo não estava disponível. No entanto, ele também forneceu o número dessa chave pública 'indisponível' na mensagem de erro: 073D307A618E5811. Assim, podemos inserir manualmente o pub_key e fazer tudo isso funcionar:
sudo apt-key adv --keyserver keyserver.ubuntu.com --recv-key CAEB3DC3BDF7FB45
Agora você pode fazer:
sudo apt update
... novamente, e o repositório deve ser atualizado com sucesso. Neste ponto você poderia apenas instalar as versões mais recentes do qgis e python através do seguinte:
sudo apt install qgis python-qgis qgis-plugin-grass
... ou você pode atualizar all os arquivos que podem ser atualizados com esta atualização do repositório de pacotes.