Sou totalmente novo no Linux, porque alguns programas que eu preciso para pesquisa em bioinformática funcionam apenas no Linux ou são facilmente operados a partir do linux.
No momento, tentando instalar um programa chamado Mothur. Após o pipeline de instalação do link do linux / unix:
1) baixou o programa 2) passou por estas etapas:
mkdir mothur
cd mothur
unzip ../Mothur.source.zip
make
o erro que recebo diz:
make: *** No targets specified and no makefile found. Stop.
Eu não tenho ideia do que isso significa.
Além disso, no tutorial, diz:
To run mothur:
./mothurHopefully, mothur will open in the interactive mode.
Isso não acontece.
Ficaria muito grato por alguma ajuda.
Basta uma verificação rápida e parece que o pacote que você está procurando está disponível na seleção de software existente.
Para instalar o terminal aberto e digite
Sudo apt install mothur
Isso deve instalar o programa que você está procurando Você poderá então encontrá-lo nos aplicativos instalados em seu sistema.
Isso é melhor do que tentar usar, se você não estiver familiarizado com o Linux.
Parece que você reverteu a ordem de dois comandos nas instruções de instalação. Deve ser:
unzip mothur.zip
cd mothur
make
O Makefile usado por make para criar o programa a partir da origem está dentro de um subdiretório motur do archive do código-fonte. Se você invocar make sem informar onde procurar por Makefile , ele apenas procurará no diretório de trabalho atual. (Além disso, ele usa seu conjunto de regras de compilação interno que não inclui uma regra de destino padrão a ser usada quando nenhum é especificado.)
Não obstante, você pode instalar o Mothur a partir do repositório de pacotes do Ubuntu:
sudo apt install mothur
" make: *** No targets specified and no makefile found. Stop. " significa que não há makefile (contendo regras para permitir que make construa seu software) no diretório atual. Após seu cd mothur , use ls para ver quais arquivos e diretórios foram descompactados. Provavelmente haverá um diretório chamado build , source ou mesmo src . Pesquise o arquivo chamado 'Makefile', cd nesse diretório e tente novamente o make .