De qualquer forma, funcionará bem. O KDE é apenas mais um skin para o Ubuntu, e o mesmo vale para o Unity. Ambas as ISOs são do mesmo tamanho, então não há vantagem a curto prazo para baixar uma ou outra.
Eu recomendo que você instale o que você mais gosta. Dessa forma, se você decidir não instalar um segundo DE ou se preferir ter uma instalação um pouco mais limpa, não precisará se preocupar em instalar um DE e desinstalar o outro.