Deve ser tão simples quanto fazer uma cópia do arquivo. Então, se algo der errado, você pode simplesmente excluir o arquivo modificado e renomear a cópia.
Eu faria:
sudo cp /etc/mysql/my.cnf /etc/mysql/my.cnf.bak
então:
sudo nano /etc/mysql/my.cnf
Para restaurar:
sudo rm /etc/mysql/my.cnf
sudo mv /etc/mysql/my.cnf.bak /etc/mysql/my.cnf