Eu pessoalmente recomendaria não instalar através do Centro de Software por esse mesmo motivo. Manter as coisas atualizadas para plugins em desenvolvimento é um pesadelo e há sempre a chance de você querer ficar com uma versão conhecida, mas a versão do repo é atualizada.
Em suma, basta fazer o download do link , colocá-lo no diretório / home dir e viver feliz sabendo que tenho algum nível de controle sobre o meu ambiente de desenvolvimento.
Isso, é claro, tem o custo de mantê-lo atualizado, mas isso é um problema menor, já que o Eclipse pode fazer isso sozinho.