A versão conflitante 3.2.1-90~trustyppa1
é proveniente do PPA estável .
A menos que você precise de algum recurso específico dessa versão, você pode remover o PPA e usar a versão que vem com utopic por padrão:
sudo ppa-purge ppa:bumblebee/stable
sudo apt-get update
sudo apt-get install bumblebee-nvidia