Depende de como o seu sistema está configurado. Normalmente, se o Windows for instalado após o Linux, ele substitui o MBR ou o setor de inicialização da unidade, instalando seu próprio BCD. O Windows BCD suporta multiboot para o Ubuntu, mas não é tão elegante quanto o GRUB. Você pode reinstalar o GRUB depois, se isso acontecer, seguindo as instruções aqui: