Você pode usar -qq -y para o apt get.
apt-get -qq -y install apache2 libapache2-mod-php5 php5
-qq = sem saída, apenas nos erros
-y = responde a todas as perguntas com sim.
apt-get -h dá uma explicação de todas as opções.
Se você gosta de instalar softwares que tenham funções interativas (como mysql, phpmyadmin) etc. e você realmente deseja instalá-los silenciosamente, você pode fazer:
export DEBIAN_FRONTEND=noninteractive
antes do comando apt-get install. Mas tenha cuidado, alguns softwares precisam ser configurados posteriormente. (Como a senha do mysql root, para o phpmyadmin você precisa vincular o apache.conf ao /etc/apache2/conf.d e assim por diante)