Tecnicamente, a resposta é "sim". Você pode usar fdisk para particionar discos MBR em uso e gdisk para particionar discos GPT em uso. O GParted também permite que você altere qualquer partição que não esteja montada, ou crie novas partições em espaços não utilizados, mas o GParted não permitirá que você altere nenhuma partição que esteja atualmente montada (ou em uso).
A grande ressalva para fdisk e gdisk é que nenhum dos dois suporta o redimensionamento dos sistemas de arquivos contidos nas partições, portanto, se você usá-los para redimensionar suas partições, correrá um risco muito alto de criar problemas que levarão à perda de dados (talvez imediatamente, ou talvez no futuro). É possível redimensionar uma partição em uso, conforme descrito em esta pergunta e suas respostas, mas isso é definitivamente algo a ser tentado apenas por especialistas. Na grande maioria dos casos, o uso de um CD ao vivo para redimensionar a partição raiz do Ubuntu ( / ) é o caminho a ser seguido. Às vezes, você pode simplesmente desmontar uma partição (como uma partição do Windows) para redimensioná-la da instalação principal.
Como uma nota lateral, se você freqüentemente precisa modificar partições em uso, usando o Gerenciador de Volume Lógico (LVM) ) é o caminho a percorrer. LVM adiciona uma nova camada sobre partições e, portanto, adiciona complexidade, o que é um grande menos; mas isso cria uma grande flexibilidade adicional quando se trata de ajustar os tamanhos dos sistemas de arquivos. Dependendo do suporte do sistema de arquivos, normalmente você pode aumentar o tamanho de um volume lógico enquanto estiver em uso com o LVM, com muito menos risco do que seria o caso se estivesse usando partições regulares. O suporte ao LVM do Ubuntu não é tão avançado quanto poderia ser, e a camada adicional de complexidade significa que o LVM não é para todos. Também pode complicar a recuperação de dados se as coisas derem errado.