Não há nenhuma razão inerente para que você não possa "fazer muitos trabalhos ao mesmo tempo".
Mas alguns trabalhos não devem ser executados ao mesmo tempo. Isso geralmente é implementado bloqueando algo.
Neste caso, você pode imaginar uma atualização que precisa do estado atual da sua máquina, mas deve ter certeza de que nada mudou. Se você está atualizando somehting (instalando o pacote X) e você executa uma atualização diferente que também precisa do pacote X, ele TAMBÉM tentará instalar esse pacote
Portanto,apt (ou aptitude, ou qualquer coisa que use o sistema de pacotes do ubuntu) não deve rodar ao mesmo tempo, e usa esse mecanismo de arquivo lock para verificar.