Seu Ubuntu é bastante seguro contra todos os vírus que você detecta.
Contanto que você não os faça , as partições não interferem umas nas outras, portanto, seu Windows deve estar seguro se você não copiar o arquivo infectado do Ubuntu para o Windows. Eu não sou o único que pensa assim. Além disso, você tem antivírus do Windows, não é?
Se você quiser passar um arquivo do Ubuntu para o Windows, pode usar algo como VirusTotal para analisá-lo.
No entanto, dizendo que é melhor prevenir, então desculpe. Verifique o wiki do Ubuntu para ver uma lista de razões, porque o Linux em geral é bastante seguro contra vírus e programas opcionais de antivírus. / p>