Por favor, note que o dd não é muito eficiente como uma ferramenta de backup, ele copia todo o espaço de partição, incluindo o uso de um espaço não utilizado. Usar partimage (pacote disponível nos repositórios) é uma opção melhor. Como a partimage não possui suporte FTP integrado, você precisaria usar algo como o curlftpfs. Não tenho certeza se seria confiável. O FTP foi projetado para fazer upload de arquivos criados anteriormente, não para atualizá-los de forma incremental.