Existem duas opções,
Se a máquina inicializar com o kernel anterior, isso funcionará.
d-i pkgsel/include
irá funcionar, e deve existir na sua configuração, anexando linux-generic-hwe-16.04
irá inicializar o kernel hwe assim que a instalação estiver completa.
Ou você pode esta linha:
d-i base-installer/kernel/override-image string linux-generic-hwe-16.04
Após esta linha:
d-i keyboard-configuration/xkb-keymap
A segunda opção é preferível na minha experiência.