A grande maioria dos pacotes nos repositórios do Ubuntu são empacotados por alguém diferente dos desenvolvedores originais. O que importa é a licença sob a qual o software é distribuído (o que determinará se você pode empacotá-lo em primeiro lugar). Se você não está vendendo na loja, o script deve estar sob uma licença que permita a redistribuição gratuita (caso contrário, você terá problemas apenas postando aqui).
Os pacotes webupd8 Java PPA , por exemplo, são essencialmente scripts que baixam e instalam o Java a partir do Site da Oracle.