Há várias opções disponíveis, a mais fácil que encontrei para o desligamento é sudo poweroff e para a reinicialização é sudo reboot . Em geral, você precisará privilégios de root para executar esses comandos (controle de segurança - evita que os usuários reduzam o sistema sem escalonamento de privilégios), embora se você realmente se cansar de digitar sudo todas as vezes, pode criar aliases vim ~/.bashrc_aliases e adicionar alias poweroff="sudo poweroff" e alias reboot="sudo reboot" . Você pode substituir vim pelo seu editor favorito.
Editar: Foi apontado para mim que as versões Desktop do Ubuntu 16.04 ou superior não requerem mais sudo para executar esses comandos, no entanto, as versões do Servidor. Obrigado Zanna por apontar isso para mim.