Obviamente, você executou um programa GUI com sudo . Esta é uma das razões pelas quais a execução de um programa GUI como root é desencorajada.
Para corrigir (não execute isso até entender):
sudo find $HOME -user root -exec chown $(id -u):$(id -g) {} +
Isso localizará arquivos e diretórios em $HOME pertencentes a root e os alterará para $UID e $GID .
man find; man id; man chown ; man sudo deve começar.