Eu sou novo no Ubuntu e atualmente o estou executando no Oracle VM VirtualBox para trabalhar com um software chamado Xmipp (mais detalhes sobre o software em
Agora, segui o guia HowToInstall , que primeiro exige que eu faça o download do Linux Binários (Ubuntu) deste link . E então, como mencionado no link HowToInstall, eu escolhi
Option 1:Using Precompiled Binaries
e executou o script install_binaries.sh. Então eu vou a seguinte mensagem:
> #!/bin/bash ID=$$ cat .xmipp.bashrc |grep XMIPP_HOME= |cut -d "=" -f 1 |sed -e "s/XMIPP_HOME/XMIPP_HOME=$(pwd | sed -e 's/\//\\//g')/g" >
> /tmp/xmipp_binary_creating_${ID} && cat $(pwd)/.xmipp.bashrc |egrep -v
> ".xmipp.cfg|XMIPP_HOME=|^#" >> /tmp/xmipp_binary_creating_${ID} &&
> echo "test -s $(pwd)/.xmipp.cfg && . $(pwd)/.xmipp.cfg || true" >>
> /tmp/xmipp_binary_creating_${ID} && mv
> /tmp/xmipp_binary_creating_${ID} $(pwd)/.xmipp.bashrc && source
> $(pwd)/.xmipp.bashrc && echo 'Xmipp3.0 binaries have been succesfully
> installed in your system. Please, put a source to .xmipp.bashrc file
> in your .bashrc file. Just for this session, .xmipp.bashrc has been
> already sourced, so if you executed the install_binaries.sh script
> with source or . changes will be applied to this shell and so, you
> should be able to execute xmipp from this terminal. If you did it with
> ./install_binaries.sh its time to source .xmipp.bashrc manually to
> have xmipp working in this shell session.'
Como a mensagem diz que os binários do Xmipp 3.0 estão instalados, eu passei para este link e seguiu as instruções mencionadas em
Running library tests (optional but recommended)
Agora, essa é a parte em que estou achando difícil seguir as instruções porque os autores mencionam que
you can run the tests by executing (from inside Xmipp home directory) the command:
xcompile gtest=yes run_tests
Agora baixei o Xmipp 3.0 como um arquivo com o seguinte nome Xmipp-3.1-linuxbin-all-x86_64.tar.gz e o extraí para a minha área de trabalho. Por isso, fui ao terminal e escrevi
cd ~/Desktop/xcompile gtest=yes run_tests
Mas então erro quando digo bash: cd: /home/shrey/Desktop/xcompile: No such file or directory . Poderia por favor explicar o que estou fazendo errado e como posso fazer o Xmipp funcionar no Ubuntu.
A última versão do Xmipp foi lançada sob uma estrutura mais geral, o Scipion (www.scipion.cnb.csic.es), que permite combinar vários pacotes EM (como Xmipp, Spider, Relion, Eman2, etc. ) no seu projecto. Por isso, recomendamos que você instale a versão mais recente do Xmipp 3 através do Scipion. No link a seguir, você encontra instruções detalhadas para o processo de instalação:
Alguns tutoriais podem ser encontrados em:
Espero que isso ajude, José Miguel