Correlação não é causalidade:
A menos que você tenha instalado Ubuntu no Windows , o que você obviamente não fez, já que está com o boot duplo :
- O Ubuntu não precisa do Windows para executar
- O Ubuntu não toca no Windwos para ser executado (somente o gerenciador de inicialização do Windows é substituído)
- O Ubuntu não usa sua partição do Windows para fazer nada além de armazenar dados (e somente se você montar a partição do Windows)
Então, a menos que você entre na partição montada do Windows para excluir arquivos, o Ubuntu não pode ser a causa da BSOD , então você deve procurar no próprio Windows a causa, o que torna a sua questão fora de tópico aqui, desculpe!