O Virtualbox, na verdade, não precisa de um sistema de arquivos específico necessário para formatar seu HDD externo. Você pode apenas formatá-lo como o Ubuntu pode ler o disco rígido e, em seguida, basta criar um novo espaço no disco rígido externo usando o aplicativo do Virtualbox.
EDITAR :
Você pode formatar seu HDD para HFS, porque o sistema de arquivos FAT tem um suporte máximo de espaço de cerca de 4 GB. Você não pode armazenar um disco virtual de 500 GB neste sistema de arquivos. No entanto, no HFS você pode armazenar uma vez que suporta grande quantidade de tamanho.