Não há um único atalho para isso. Mas no Ubuntu com desktop Unity, você tem uma alternativa - Unity Hud.
Pressionar Alt mostra o menu de pesquisa, onde você pode procurar por entradas de menu específicas que você deseja (de Arquivo, Editar, Visualizar e outros). Basta procurar por Preferences, e você será presenteado com uma opção para isso (se o aplicativo em si tiver menu Preferences; se os desenvolvedores não o colocaram lá, bem ... não há muito o que você pode fazer sobre isso)
