xkill ... você sempre pode abrir um terminal Ctrl + Alt + t e executar xkill , depois clicar na janela do programa que não responde.
O xkill deve ser instalado antecipadamente, mas está disponível nos repositórios oficiais do Ubuntu.
Como alternativa, você pode abrir o terminal, execute top para determinar o pid do programa que você deseja fechar. Pressione q para sair na parte superior e execute kill [pid]