Para criar ou modificar os arquivos .desktop para aplicativos e scripts, você pode usar Arronax . Permitirá uso para mudar ícones. Ele também permitirá que você crie arquivos .desktop a partir do zero.
Para instalá-lo, use o Synaptic. Inicie o Synaptic no painel. Clique no ícone RELOAD, no ícone SEARCH, entre com arronax
, verá três resultados, marque-os de instalação e clique no ícone APLICAR.
update:senãoestivernoseuSynaptic,vocêpodeacessardiretamenteosite