Se você já instalou o nvidia através do apt-get, seu software será atualizado junto com todo o resto do seu software quando você executar os seguintes comandos:
sudo apt-get update
sudo apt-get dist-upgrade
Não há necessidade de instalar mais nada.
No entanto, de acordo com a nvidia, você deve usar a versão 361. Se o 361 não estiver disponível para a sua versão do Ubuntu (é para 16.04), então você deve usar 352 que você já instalou.
Execute os seguintes comandos para instalar a versão 361, se ela estiver disponível, caso contrário, você já está pronto:
sudo apt-get update
sudo apt-get install nvidia-361