Eu sei :) Eu sou um idiota:)
eu fiz chmod -R 777 /usr
Consegui executar chmod -R 755/usr do modo de recuperação. Agora quase todos funcionam bem. Mas a atualização do software e alguns outros futuros ainda não funcionam.
Alguém conhece as permissões padrão para o conteúdo de /usr ?
Bem, você usou o sinalizador -R (recursivo) e, em seguida, seu sistema foi parafusado, a melhor solução é reinstalar o Ubuntu.
Outra maneira de consertá-lo é instalar a mesma versão do Linux em outra máquina (ou VM) e depois copiar /usr para a máquina antiga, boa sorte.