você está instalando o eclipse do repositório do Ubuntu? ou baixar do eclipse?
IMHO você precisa instalar o eclipse manualmente.
primeiro você instala o subversion:
sudo apt-get install subversion
se você quiser instalar o plugin do subversion para eclipse, você pode instalar usando o menu Help -> Install New Software
, escolha Helios ou Galileo:
escolha Collaboration
e selecione Subversivo: