você está instalando o eclipse do repositório do Ubuntu? ou baixar do eclipse?
IMHO você precisa instalar o eclipse manualmente.
primeiro você instala o subversion:
sudo apt-get install subversion
se você quiser instalar o plugin do subversion para eclipse, você pode instalar usando o menu Help -> Install New Software , escolha Helios ou Galileo:
escolha Collaboration e selecione Subversivo: