Parece que você pode encontrar uma solução nos fóruns do Ubuntu aqui; link baixe o script python instale os pré-requisitos,
sudo apt-get install python-tk python-imaging python-imaging-tk
executar o aplicativo, carregar o arquivo, selecionar áreas para cortar com o mouse e clique em ir, as imagens das áreas serão salvas no arquivo na pasta com a foto. veja abaixo:
Exibiçãodearquivosnonautilus