O que você baixou é o código-fonte do WineHQ, ou seja, o código do qual você teria que construir o próprio programa.
Como você não o instalou, mas apenas o baixou, pode simplesmente removê-lo se achar que não precisa compilá-lo. (E não é a coisa mais fácil de começar como um iniciante no Linux ...)
No entanto, não há necessidade de removê-lo; você pode simplesmente instalar o Wine a partir do centro de software sem conflitos.
Melhor, instale também o PlayOnLinux, um frontend para o Wine. Ele envia scripts de instalação para muitos jogos e softwares, e pode gerenciar diferentes ambientes Wine - cada um com sua própria versão Wine, se necessário - para manter diferentes softwares separados uns dos outros.