Você deve instalar o GRUB na sua partição de inicialização (se estiver inicializando o Windows com sucesso). Obviamente, as configurações da BIOS estão configuradas para inicializar a partir dessa unidade, portanto, possui uma partição de sinalizador inicializável. O GRUB não deve falhar na inicialização do Windows se a sua unidade externa não estiver presente, mas logicamente não será possível inicializar o ubuntu se a unidade externa não estiver conectada. Se você conectar um disco externo, ele poderá inicializar no Windows e no Ubuntu.