Eu tive um problema de exibição semelhante recentemente (sem renderização de contorno de botões / caixas de seleção / guias, preenchimento ausente entre elementos da interface do usuário) - basicamente minha interface do usuário parecia lixo - facilmente perceptível no aplicativo 'Calculadora'.
Descobri que, se eu mudasse o meu tema para 'alto constrast', essas coisas renderizadas corretamente - se você tiver os mesmos sintomas, a mesma correção provavelmente poderá ser aplicada - reinstale os temas padrão (Ambiance e Radiance):
sudo apt-get install light-themes
Talvez seja necessário usar a ferramenta de ajuste de unidade para alternar o tema. Instale-o via sudo apt-get install unity-tweak-tool
, se necessário.