O SSD é como o HDD, o particionamento não é um problema além de resultar em um espaço em disco muito pequeno. Eu consegui dual tanto em um 120GB, mas eu mal usei windows.
O post vinculado sugere que não é uma ótima idéia colocar swap em seu SSD, ele não diz que o particionamento é ruim. A troca no SSD é boa, torna a suspensão / hibernação super rápida. Ele pode ficar um pouco mais rápido, mas o SSD não foi projetado para armazenamento a longo prazo e você deve ter backups.
O USB 3 tem quase a mesma velocidade que o sata, por isso, se o seu uso for desigual, sugiro colocar o SO menos usado no disco externo.
Depende realmente da sua carga de trabalho e da quantidade de memória RAM que você tem, se estiver editando grandes arquivos de mídia e realmente precisar da velocidade bruta, nada será melhor do que uma instalação completa do SSD. Da mesma forma, se você tiver menos de 4 GB de memória RAM, o disco rápido é essencial, já que você entrará e sairá muito da memória.
Se você tiver seu sistema operacional no SSD e seus dados no disco rígido, você perceberá quando tocar no HD, pois o sistema ficará lento. Se é possível obter um sistema e seus dados de trabalho definidos no SSD, então pode ser o caminho a percorrer se você realmente precisar de desempenho.