Eu sugeriria uma re-instalação da versão que você quer usar (Ubuntu, kUbuntu etc). Se você adicionou documentos pessoais, faça um backup desses documentos e restaure-os depois de terminar.
% bl0ck_qu0te%Nesse caso, isso ...
sudo apt-get update
sudo apt-get install ubuntu-desktop
irá adicionar o desktop Ubuntu ao seu sistema.
Isso ...
sudo apt-get update
sudo apt-get install kubuntu-desktop
irá adicionar o desktop kUbuntu ao seu sistema. O mesmo se aplica a outras versões (basta alterar o pacote de instalação para o que você deseja).
Se você quiser remover o edubuntu, você pode fazer isso com ...
sudo apt-get remove --purge edubuntu*
sudo apt-get autoremove
O último comando removerá pacotes que não são mais necessários, mas que não foram removidos. Sugiro fazer isso depois que você confirmar que a área de trabalho recém-adicionada está funcionando.
Mas, como é importante fazer um backup antes de fazer isso, aconselho fazer uma reinstalação. É o método mais fácil e provavelmente mais rápido para voltar a funcionar.