Sua área de trabalho está sendo executada em um usuário normal e não como usuário root. Por isso, você pode acessar arquivos criados pelo root somente por meio do terminal
Depois de logar como root em um terminal, posso criar novos diretórios, mas não posso ver nem acessá-los manualmente clicando com o mouse quando fizer login como usuário normal na GUI. Eu só posso acessá-los através do terminal. Por que isso é assim?
Sua área de trabalho está sendo executada em um usuário normal e não como usuário root. Por isso, você pode acessar arquivos criados pelo root somente por meio do terminal