O Ubuntu permite o cache de gravação para mídia USB por padrão, o Windows não (pelo menos no XP e 7).
Ao usar o Write Chaching, seus arquivos são gravados em um buffer, que é gradualmente gravado na unidade USB. Se o arquivo inteiro tiver sido gravado no buffer, o diálogo informará que a cópia foi concluída, enquanto o sistema operacional ainda está ocupado movendo os arquivos do buffer para a unidade flash.
É por isso que você deve sempre usar o método "ejetar com segurança" no Ubuntu , pois ainda pode haver arquivos no buffer que serão perdidos se você simplesmente desconectar a unidade flash.
Eu não recomendo desabilitar esse recurso (embora você possa ) porque aumentará muito o desgaste de seus pen drives (consulte esta discussão porque é uma má ideia).