Acho que por algum motivo você excluiu o arquivo de configuração do envvars
Jul 06 10:34:49 archisman-HP-ProBook-440-G2 apache2[8899]: /etc/init.d/apache2: 64: .: Can't open /etc/apache2/envvars
Jul 06 10:34:49 archisman-HP-ProBook-440-G2 apache2[8899]: /etc/init.d/apache2: 76: .: Can't open /etc/apache2/envvars
Você tem que criá-lo e colar o conteúdo de aqui (conteúdo padrão para este arquivo)
sudo touch /etc/apache2/envvars
sudo nano /etc/apache2/envvars
Em seguida, reinicie o serviço do apache como de costume
sudo service apache2 restart