desculpe ouvir sobre o assunto
Com todas as instalações de inicialização dupla que eu fiz, o processo de instalação / instalação sempre detecta o sistema operacional instalado alternadamente sem problemas ou problemas.
Eu tenho em uma configuração normal 1xWindows, 1xDebian (ou outro Linux), 1x Ubunutu
Por que você não consegue reinstalar o Windows - algum erro específico?
Considere também adicionar manualmente o seu Windows ao Grub se você não quebrar a estrutura da partição.