Instalação do arquivo no Ubuntu

Question

Eu apenas tentei instalar este arquivo aqui na minha máquina Ubuntu 14.04.

Quando eu clico nele o ubuntu abre um diálogo para instalar pypar2 que eu fiz e então o arquivo é aberto com pypar2 se parece com isto:

Mas depois eu não consigo executar o msmc na área de trabalho.

    

Answer 1

Esses são arquivos pré-compilados. Não há mais nada para instalar, olhando para o README. Você os executa. Primeiro, torne o arquivo executável:

$ chmod +x msmc_linux_64bit 

Em seguida, execute:

$ ./msmc_linux_64bit 
Usage: msmc [options] <datafiles>
  Options:
    -i, --maxIterations=<size_t> : number of EM-iterations [default=20]
    -o, --outFilePrefix=<string> : file prefix to use for all output files
    -r, --rhoOverMu=<double>: ratio of recombination rate over mutation rate. Default=0.25.
    -t, --nrThreads=<size_t> : nr of threads to use (defaults to nr of CPUs)
    -p, --timeSegmentPattern=<string> : pattern of fixed time segments [default=10*1+15*2]
    -P, --subpopLabels=<string> comma-separated subpopulation labels (assume one single population by default, with 
          number of haplotypes inferred from first input file). For cross-population analysis with 4 haplotypes, 2 
          coming from each subpopulation, set this to 0,0,1,1
    -R, --fixedRecombination : keep recombination rate fixed [recommended, but not set by default]
    -I, --indices: indices (comma-separated) of alleles in the data file to run over
    -s, --skipAmbiguous: skip sites with ambiguous phasing. Recommended for gene flow analysis
    -h, --help: show this message