Você pode usar o comando dd
sudo dd if=/dev/sdx of=/dev/usbx bs=1m
Para mais informações, você pode ler o seguinte fórum: link
Tenho o Ubuntu instalado no meu laptop HP G7000 e gostaria de copiar arquivos do meu disco rígido interno para o disco rígido USB, para que eu pudesse instalar o Windows no meu computador, mas ainda assim ser capaz de usar o Ubuntu. Não tenho espaço suficiente no meu disco rígido interno para que o dual boot não funcione.