Desculpe ... Não é tão fácil.
O que você tem que entender para ver porque isso não funciona é que quando o MySQL Server está rodando, ele assume (com algumas exceções limitadas que não são importantes, aqui) que nada mais será mexer com seus arquivos, e que mantém alguns conceitos internos, em memória, sobre o estado dos arquivos, que assume não podem se tornar inconsistentes com os arquivos. Se os arquivos se tornassem inconsistentes, através de algum tipo de sincronização, então você teria basicamente um banco de dados corrompido em suas mãos.
Quando o MySQL Server é encerrado de forma limpa, ele deixa os arquivos em um estado apropriado - ele ou outra cópia do MySQL Server com uma configuração suficientemente idêntica - pode abrir os arquivos e começar a executar ... mas depois de um gracioso desligamento do servidor é o tempo somente que isso é verdade.
A única maneira de sincronizar duas instâncias do MySQL Server é copiar todos os arquivos, somente em uma direção, com ambos os servidores em estado parado.
A mesma advertência se aplica ao MariaDB e ao Percona Server.