Eu não sou um usuário do Samba, mas talvez isso ajude você.
Eu uso o ssh para compartilhar entre meus vários PCs. Abra uma sessão de terminal e digite o seguinte:
sudo apt-get install openssh-server
Uma vez instalado, eu uso
Nautilus --- > Arquivo --- > Conecte-se ao servidor
Digite o endereço IP do PC com o qual você está tentando se conectar a > Altere o tipo para SSH > insira o restante de suas credenciais para essa máquina.
Além disso, você poderia explorar usando sua pasta Ubuntu One para isso. Desta forma, seus arquivos serão mantidos atualizados em ambas as máquinas, além de terem acesso remoto.
Boa sorte