O diretório home deve conter os dados pessoais do usuário, incluindo os arquivos de configuração que podem ser editáveis sem risco para a integridade do sistema.
A casa do usuário deve nunca conter arquivos de sistema desprotegidos de qualquer tipo.
Os arquivos de configuração são (muito) frequentemente ocultos ( .configuration_file_name ) ou colocados em subdiretórios ocultos, para evitar problemas de ordem.
Em um terminal (xTerm ou Terminal são bons) use cd (sem parâmetros) para configurar o diretório de trabalho atual para seu home . Execute ls -lAh para ter uma boa lista de qualquer arquivo no diretório atual.
Você também pode usar qualquer navegador gráfico com a opção "Mostrar arquivos ocultos" ativada para manipular arquivos ocultos.
Por favor, não hesite em comentar aqui se você tiver mais perguntas e lembre-se de pressionar a seta para cima da esquerda se eu for de alguma ajuda.
Eu sugiro seguir um guia para sistemas Unix , qualquer guia será bom para essas dúvidas básicas. :)
Tenha um bom dia.