a melhor maneira que encontrei para sincronizar as configurações do Thunderbirds, até mesmo as caixas de correio das máquinas usam o TEBE link
É uma ramificação off do FEBE (firefox), mas como agora o Firefox tem sua própria sincronização, o FEBE tornou-se menor, ainda é ótimo para fins de backup off-line.
No entanto, o FEBE ainda é a principal ferramenta que uso para manter minhas configurações do Thunderbird em todas as máquinas, uma vez que o Thunderbird ainda não possui uma ferramenta de sincronização on-line como o Firefox.e TEBE tem a opção de sincronização BOX.net, para que você possa buscá-lo em outro computador via TEBE, conectando-se à mesma conta, após cada backup agendado ou backup manual.
Você também pode especificar o que fazer backup e o que pular.