Se esta for uma área de trabalho (parece que é a partir da sua pergunta)
Em seguida, a maneira mais simples é desanexar a unidade SATA durante a instalação (se puder fazê-lo com segurança), caso contrário
Durante a instalação do ubuntu, selecione a opção
something else option 
Entãovocêveráomenudepartiçõesdaseguinteforma
Se você conectou dois discos rígidos, verá dois dispositivos como /dev/sda /dev/sdb . Você terá que identificar qual é a unidade IDE em branco. É muito simples ... o que tem algumas partições ntfs é uma unidade SATA. enquanto o que mostra espaço completamente não alocado é o seu drive IDE em branco. Você pode selecionar a unidade IDE em branco e fazer partições nela e, em seguida, abaixo em
Device for Bootloader installation
selecione seu disco rígido IDE (/ dev / sda ou / dev / sdb) Quando a instalação estiver concluída, você pode reiniciar o computador e, no momento da inicialização, basta acessar o BIOS e selecionar de qual disco rígido você quer inicializar. Se você selecionar seu disco rígido SATA, ele será inicializado diretamente no Windows, se você selecionar seu HDD IDE, ele mostrará o menu do grub (se não estiver oculto: p)
Espero que isso ajude!