@arokath Como você, não consegui encontrar o suporte a jp2 na versão do ImageMagick que instalei através do apt-get (Ubuntu 16.04.1 LTS).
Antes de criar a partir da fonte (seguindo os documentos do ImageMagick ), instalei primeiro libopenjp2-tools e depois %código%.
Observação : não sei qual deles fez o truque: o resumo em ordem alfabética no final de libopenjp2-7-dev listou o suporte a jp2 como configure , em vez de OpenJP2 que eu usei notará até que eu tenha instalado JP2 e reconfigurado; é bem possível que funcionou apenas com a primeira lib.
Além de libopenjp2-7-dev , ./configure e make , descobri que precisava (como sugerido nos documentos) "configurar o vinculador dinâmico": make install .
Agora, a saída de sudo ldconfig /usr/local/lib contém:
J2C* rw- JPEG-2000 Code Stream Syntax (2.1.0)
J2K* rw- JPEG-2000 Code Stream Syntax (2.1.0)
JNX* r-- Garmin tile format
JP2* rw- JPEG-2000 File Format Syntax (2.1.0)
JPC* rw- JPEG-2000 Code Stream Syntax (2.1.0)
JPM* rw- JPEG-2000 File Format Syntax (2.1.0)
JPT* rw- JPEG-2000 File Format Syntax (2.1.0)
JSON -w+ The image format and characteristics