Para responder às suas perguntas numeradas,
- Existe um artigo abrangente sobre isso no wiki do Debian .
- Coberto em 1.
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Os pacotes são divididos em diferentes 'componentes', dependendo de sua licença e suporte, da seguinte forma:
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Principal - Software oficialmente suportado.
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Restricted - Software suportado que não está disponível sob uma licença totalmente gratuita.
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Universo - Software mantido pela comunidade, ou seja, software não suportado oficialmente.
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Multiverso - Software que não é gratuito.
A licença exata para cada pacote é diferente e você deve verificar individualmente.
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Listados aqui: link
O seguinte é um trecho do acima:
- Gerenciador de Pacotes Synaptic, uma interface gráfica de usuário GTK +
- Ubuntu Software Center, uma substituição de interface gráfica do usuário GTK + para o Synaptic
- aptitude, uma alternativa versátil ao dselect
- KPackage, parte do KDE
- Adept Package Manager, uma interface gráfica do usuário para o KDE (deb, rpm, bsd)
- PackageKit, um frontend do freedesktop.org.
- GDebi, uma ferramenta baseada em GTK patrocinada para o Ubuntu. (Há também uma versão do Qt, disponível nos repositórios do Ubuntu, um gdebi-kde.)