Você instalou o gerenciador de inicialização do grub2 no PBR ou no setor de inicialização de partição do Windows. O Windows precisa ter seu código de inicialização em sua partição NTFS.
Correção para a maioria, alguns têm outros problemas, melhor que a correção do Windows em muitos casos, pois também corrige outros parâmetros:
Isto tem instruções sobre o uso do testdisk para reparar a instalação do grub no setor de inicialização para Windows a partir do Ubuntu ou Linux LiveCD.
[HowTo] Reparar o setor de inicialização de uma partição do Windows - YannBuntu
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