Talvez não coincidentemente eu tenha tido esse problema duas vezes depois de usar o Bleachbit. Em ambos os casos, pode ter acontecido quando eu tive que desligar o Bleachbit antes de terminar a execução, porque parecia ter congelado (várias horas, mas meu disco não é muito grande).
No meu caso, eu acidentalmente configurá-lo para limpar o espaço vazio e, tendo congelado / morto durante este processo, parece ter deixado uma pasta nomeada aleatoriamente com muitos arquivos que eu acredito (mas don ' Não tenho certeza), são criados como parte do processo de limpeza do espaço livre no disco rígido. (Nautilus nunca poderia realmente exibir os arquivos - ele apenas mostrou o ícone ocupado ao tentar carregá-los, então eu suponho que eles eram os muitos arquivos criados como resultado do processo de limpeza da unidade).
Como Mitch disse que eu finalmente descobri que só poderia esvaziar a lixeira desses arquivos excluindo o diretório oculto ~/.local/share/Trash/files
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Credite em Mitch por responder a esta pergunta (se ele a repassar como resposta), mas achei que minha experiência elucidaria uma possível causa desse problema, ou seja, se você tivesse que matar o Bleachbit ou ele caísse, ele poderia ter deixado arquivos danificados que não puderam ser excluídos normalmente.