O Apache não o desativa, pois o Apache não conhece uma variável DISPLAY. DISPLAY está relacionado ao sistema X Window.
Se você quiser definir o DISPLAY, usaria /etc/rc.local
. Mas você deve certificar-se de que o comando para configurar a variável DISPLAY seja chamado antes de iniciar o servidor de aplicativos.
#!/bin/sh -e # # rc.local # # This script is executed at the end of each multiuser runlevel. # Make sure that the script will "exit 0" on success or any other # value on error. # # In order to enable or disable this script just change the execution # bits. # # By default this script does nothing.