Eu pessoalmente uso gnome-terminal como meu emulador de terminal. Usando o gnome-terminal, eu corro o GNU Screen ( byobu para ser específico) para trabalhar com várias janelas. Você pode se tornar realmente eficiente com isso. Eu uso o GNU Screen porque muitas vezes eu tenho sessões de longa duração que posso verificar ou voltar mais tarde.
gnome-terminal executando byobu (mostrando apenas uma janela aberta)
Você parece mais interessado em uma solução gráfica para gerenciar janelas de terminal. Para isso, eu sugiro o emulador de terminal Terminator , que suporta várias janelas sem a necessidade de um multiplexador como o GNU Screen. Você pode dividi-lo na horizontal e na vertical, tanto quanto você gosta e há até mesmo guias. Se você sente que está executando muitos terminais, o Terminator é realmente bom.
Terminator (mostrando várias janelas Terminator abertas)