Desativar a indexação de email. Eu tive o mesmo problema e fui embora quando desativei a indexação de e-mail. Meu palpite é que, se você tiver muitos e-mails (por exemplo, Gmail com muitos e-mails arquivados em "Todos os e-mails"), levará muito tempo para indexar o conteúdo deles.
Para desabilitar isso, vá para Nepomuk Server Configuration e desmarque a opção "Enable Email Indexer" em "Email Indexing".